市农科院在木瓜种植方面拥有丰富的研究与实践经验，建国前对曹州木瓜栽培技术就有研究，近年来，致力于木瓜的种植技术研究、品种改良以及产业推广。现院内建有木瓜种质资源圃25亩，在县区建有木瓜基地350多亩。
在品种改良方面，通过收集、引进和选育优良品种，不断优化木瓜的品种结构。筛选出了适应性强、产量高、品质优的木瓜品种玉兰、豆青、粗皮剩花、细皮子、大佛手、小佛手、狮子头等12个品种，种植百年古树82棵；选育出曹州木瓜新品种2 个，分别为“金玉兰”和“蒙山翠”；提纯复壮了2个曹州名优木瓜品种“豆青”和“玉兰”；并通过推广种植，提高了木瓜的整体种植水平。
在木瓜栽培技术方面，针对木瓜的生长特性，开展了一系列深入研究。总结出曹州木瓜的造型修剪技术，开展曹州木瓜温室和露地播种育苗试验，成功育苗1200多株；试验并推广“木瓜生态种植技术”、“木瓜+丹参果药套种技术”和“木瓜+大豆果粮套种技术”，增加了种植收益。此外，还积极与企业合作，推动木瓜产业的深加工和市场化发展，为当地经济增长注入新的活力，助力全市乡村振兴战略。
